期刊简介
本刊是反映本校科研、医疗工作及同国内外医学界交流的重要窗口，在编排上达到了规范化的要求，注意适应国内外文献检索系统收录的需要并逐步完善，成为一本具有较高水平的医学科学技术性刊物。
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首页>中国医科大学学报杂志
- 杂志名称：中国医科大学学报杂志
- 主管单位：辽宁省教育厅
- 主办单位：中国医科大学
- 国际刊号：0258-4646
- 国内刊号：21-1227/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：1997年中共中央宣传部第二届全国优秀科技期刊三等奖期刊收录：农业与生物科学研究中心文摘, 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 剑桥科学文摘, 哥白尼索引(波兰), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 万方收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), CA 化学文摘(美)
hsa-miR-138的生物信息学分析及分子调控通路预测
孙丹；于萌；郑明星；高营；朱育焱
关键词：hsa-miR-138, 生物信息学, 靶基因, 信号通路
摘要：目的 对hsa-miR-138进行靶基因、功能富集分析(GO分析)、信号通路富集分析及转录因子预测等生物信息学分析,为后续深入研究hsa-miR-138功能提供实验验证的理论基础.方法 通过UCSC基因组浏览器、TargetScan、starbase、DAVID及KEGG公共数据库、Chipbase等在线工具分析hsa-miR-138序列,预测hsa-miR-138-1的靶基因,对预测的靶基因进行GO分析和信号通路富集分析,预测hsa-miR-138的可能转录调控因子.结果 hsa-miR-138序列在各物种间具有高度保守性.通过对目前文献的检索,发现hsa-miR-138-1的靶基因中既有抑癌基因,也有癌基因.GO分析发现hsa-miR-138-1靶基因主要富集在转录调控、转录、RNA代谢过程的调节、基因表达、生物大分子的合成等方面(P＜0.01),KEGG通路分析提示相关信号通路主要涉及癌症通路、轴突导向、细胞内噬作用、Wnt信号转导、神经营养因子信号转导等重要生理病理过程.应用Chipbase预测出hsa-miR-138的19个调控转录因子.结论 hsa-miR-138可能参与多种重要的生物学过程,并作为双向调节因子调控肿瘤的生物学行为.
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